洁净室设计是在设计者掌握了洁净室的定义、分类和技术要素的前提下进行的、洁净室设计方案阶段的调查研究设计方案阶段的调查研究主要是收集相关的数据和资料。
1.收集与生产工艺相关的数据和资料
室内温湿度的基数和精度，需要与工艺设计人员反复讨论确定并定下合理的参数，不要一味追求高标准。有些工艺设计人员在提温湿度参数时把室内温度基数定得过低，相对湿度基数也过低，而精度要求提得过高，洁净度的要求也是提得就高不就低，这样不仅使空调净化设计增加了难度，也抬高了初投资和系统运行费用。当然满足生产工艺的基本要求是完全有必要的。
在收集计算冷热负荷的工艺资料时要注意工艺设备的发热量是电动设备产生的还是电热设备产生的，是否有工艺排风可能将室内冷热量带到室外，同一区域内的工艺设备同时使用情况如何，工艺设备的使用率如何，不同班次人员的多少等。这些因素都要在做冷热负荷计算时考虑，取一个符合实际情况的系数
2.收集工程所在地的气象资料和周围环境的资料
（1）室外设计参数。除一年四季的气象资料外，还需要收集工程所在地的环境资料，如含尘浓度和会影响产品质量和生产工艺的各种气体的浓度。
（2）工程周围公路、铁路、码头、飞机场等交通枢纽和交通要道的距离。
（3）工程周围的工厂、仓库、堆场的距离。
3.收集生产过程中发生的废热和有毒有害废气的相关资料
（1）确定废热的温度和废气的排风量，如排出的废热、废气与室外的温差大且风量又大，可考虑进行冷热回收。
（2）确定有毒有害气体的浓度、温度和对操作人员的危害程度及必需的排风量，并要考虑排放前的净化处理措施。
（3）收集生产工艺对电、水、特种气体、大宗气体的要求，如大宗气体对电磁波的干扰，水质的电导率、水温，特种气体的纯度、洁净度。
4.收集工程建筑、结构和工艺设计的平面图、剖面图。
二、洁净室设计方案阶段的文件要求
1.设计总说明
设计总说明中应列出设计依据、设计要求及主要技术经济指标。
2.总平面设计说明
总平面设计说明的内容包括：概述工程场地现状特点和周边环境情况及地址地貌特征；详尽阐述总体方案的构思、意图和布局特点，以及竖向设计、交通组织、防火设计、景观绿化、环境保护等方面所采取的措施，并强调远离严重空气污染、振动和噪声区域对于一期规划、分期建设的项目要有专门的说明。
3.工艺平面布置
工艺平面布置应合理紧凑，洁净室或洁净区域内只布置必要的工艺设备，以及有空气洁净度要求的工序和工作室。在满足生产工艺和噪声要求的前提下，空气洁净度等级高的洁净室或洁净区宜靠近空调机房，空气洁净度等级相同的工序和工作室宜集中布置。应考虑大型设备安装和维修的运输路线，并预留设备安装囗和检修口。洁净厂房的平面和空间设计应满足生产工艺和空气洁净度等级要求。洁净区、人员净化区、物料净化区和其他辅助用房应分区布置。
4.建筑设计说明
建筑设计说明包括：建筑方案设计的构思和特点；建筑群体和单体的空间处理；平面和竖向构成；如何和工艺及其他各工种协调并满足功能要求；建筑功能布局和各种出入口垂直交通运输设施的布置；建筑内部的交通组织；防火和安全疏散设计；建筑节能设计说明等
5.结构设计说明
（1）工程概况。包括：工程地点，工程分区，主要功能，各单体建筑的长、宽、高，地上与地下层数，各层层高，主要结构跨度，特殊结构及造型，洁净厂房对抗微震的要求及特殊设备对基础的要求等。
（2）设计依据。包括：主体结构设计使用年限，自然条件，风荷载，雪荷载，抗震设防烈度，工程地质概况，工艺和其他专业提出的吊挂荷载，结构专业设计所执行的主要法规和所采用的主要标准。
（3）建筑分类等级。包括：建筑结构安全等级，建筑抗震设防类别，钢筋混凝土结构的抗震等级，地下室防水等级。有条件时说明地基基础设计等级。
（4）上部结构及地下室结构方案。主要包括结构设缝（伸缩缝、沉降缝、抗震缝）的设置，特殊结构宜进行方案可行性的论述。
（5）基础方案。包括：基础选型及持力层，对相邻既有建筑物的影响等。
（6）主要材料。包括：混凝土强度等级，钢筋种类，钢绞线或髙强钢丝种类，钢材牌号，砌体材料，其他特殊材料或产品的说明。
（7）需要特别说明的其他问题。有时候需要进行风洞试验、振动台试验、节点试验等。
6.电气设计说明
电气设计说明包括：工程设置的电气系统，变、配、发电系统，负荷级别以及总负荷的估算容量，电源、城市电网提供电源的电压等级、回路数、容量，工程设置的变、配发电数量和位置，自备应急电源的形式、电压等级、容量，电气节能措施。
7.给排水设计说明
（1）给水系统。设计说明包括：水源情况简述（包括自备水源及市政给水管网）及用水量估算、总用水量（最高日用水量、最大时用水量）、消防用水量（用水量标准、一次灭火用水量）、给水系统及其供水方式、消防系统及其种类和供水方式
（2）中水系统。设计说明包括：设计依据、处理水量及处理方法。
（3）循环冷却水系统。设计说明包括：重复用水及采取其他节水节能减排措施。
（4）排水系统。设计说明包括：排水体制、工业废水的处理与排放、生活污废水排放的合流或分流。
（5）纯水系统。是给排水专业在洁净工程设计中的重点。设计说明包括：纯水的量、纯水的级别及处理流程的表述
8.采暖通风与空气调节设计说明
采暖通风与空气调节设计说明包括：釆暖通风和空气调节设计范围，采暖和空气调节的室内设计参数，洁净度级别及设计标准，冷热负荷估算数据，采暖和空气调节冷热源的选择及其参数，采暖和空气调节的系统形式及控制方式，通风系统要点，防排烟系统及暖通空调系统的防火措施，节能设计要点，废气排放处理和降噪减振等环保措施，需要说明的其他问题。
9.热能动力设计说明
供热设计说明包括：热源概况及供热范围，锅炉房及场地面积，区域供热时换热站的面积，供热负荷估算，供热方式及供热参数，热力管道的布置及敷设方式，水源、水质、水压要求。对于其他动力站房，设计说明包括：站房内容和性质，洁净厂房对压缩空气真空、大宗气体和特种气体的要求，站房面积，各种气体的技术参数及气体处理流程，系统形式，用气量的估算，节能环保措施，消防及安全措施。
10.投资估算说明
投资估算一般由编制说明、总投资估算表、单项工程综合估算表等内容组成。
编制说明包括：编制依据、编制方法、编制范围、主要技术经济指标、其他需要说明的问题总投资估算表包括：工程费用、其他费用、预备费（包括基本预备费用、价差预备费）、建设期贷款利息、铺底流动资金。
单项工程综合估算表包括：建筑工程费用、装饰工程费用、机电设备及安装工程费用、室外工程费用等。
三、设计方案阶段的设计图
1.总体
总平面图、竖向布置图。
2.建筑
平面图、立面图、剖面图。
3.结构
基础平面图、主要楼层结构平面布置图（结构关键性节点，伸缩缝，沉降缝，防震缝）。
4.电气
电气总平面图（变配电系统、配电系统、照明系统、火灾自动报警系统、通信网络系统、防雷系统、其他系统）、主要电器设备表。
5.给排水
建筑给排水总平面图、建筑给排水局部总平面图、建筑室内给排水平面图和系统原理图、水处理流程图、纯水制备系统图、主要设备器材表。
6.采暖通风与空气调节
采暖流程图、通风流程图、空调流程图（流程图也可称原理图）、主要平面图（各种管道、风道可绘单线图）、洁净室空气流程图（原理图）、冷热源流程图（原理图）、采暖平面图、通风（空调、防排）烟平面图、冷热源机房平面图、主要设备表。
7.动力
锅炉房、热交换站、热力系统平面图（系统图），压缩空气站平面图（系统图），大宗气体站平面图（系统图），特气站平面图（系统图），主要设备表。
四、扩初设计阶段
扩初设计也称为扩大初步设计，应该是主要的技术设计阶段。扩初设计的深度要比方案设计阶段更深。所有的技术参数都要在扩初设计阶段反映。各个专业的主要计算也应该在扩初设计阶段完成。洁净厂房的设计和民用建筑设计及一般工业建筑设计的不同之处是所有专业的设计都是为了满足工艺的需求。改革开放以来，有洁净要求的建筑的工艺设计大多数是由较先进的国家引进，由于这些国家的体制与我国有很大的区别，所以项目审批的程序也有所不同。通常的做法是用方案设计代替扩初设计报建设单位的上级部门和政府主管部门审批。这就对方案设计提出了更高的要求，尤其是文件深度上的要求就更高了。
所以前面所讲的方案设计阶段的要求，就比城乡建设部的文件《建设工程设计文件编制深度规定》的要求更多。作为设计人员也应该要适应这样的变化，严格执行国家的规范和法规。在《建筑工程设计文件编制深度规定》的条文说明中提到初步设计文件用于审批包括政府主管部门和/或建设单位对初步设计文件的审批），若无审批需要，初步设计也无出图的必要。因此对于无审批需求的建筑工程，经有关主管部门同意，且合同中有不做初步设计的约定，可在方案设计审批后直接进入施工设计。但对方案设计的深度还是有要求的。
五、施工图设计
城乡建设部在《建筑工程设计文件编制深度规定》中对施工图设计的文件深度有详细明确的规定，设计单位的每一个专业都应该严格按照这一规定执行。但是有洁净要求的建筑有其特殊性，一般情况下允许建筑专业将室内装饰设计，给排水、电气暖通空调、动力专业将与工艺设备连接的管线和部分设备，作为二次设计的内容，以待工艺设备订购后或工艺设备安装时再进行，以免发生定位有误，造成修改和接线接管的困难。
